• Eared seal
• East asian alder
• East Asian mallotus

• ebenus, Mitra
• ebenus, Pusia
• Ebony miter

• Ecdyonurus yoshidae
• Echinarachnius属
• Echinarchnius brevis
• Echinarachnius (Kewia) minuta
• Echinarachnius minuta
• Echinarachnius mirabilis
• Echinarachnius (Scaphechinus)亜属
• Echinarchnius (Scaphechinus) brevis
• Echinarachnius (Scaphechinus) mirabilis
• Echinaria属
• Echinauris lateralis
• Echinocorys ovatus
• Echinoderm
• Echinodermata門
• Echinodiscus chikuzenensis
• Echinoid
• Echinoidea網
• Echinolampas属
• Echinolampas yoshiwarai
• Echinolampus属
• Echinophyllia aspera
• Ectomaria multicostata
• Ectoprimitia属

• edentula, Tellinimactra
• edoensis, Parafusulina

• eggeri, Globigerina
• egregius, Patinopecten

• ehimense, Clisiophyllum
• ehrenbergii, Actinocyclus
• ehrenbergii, Arachnoidiscus

• Elaeagnus属
• Elaeagnus mikii
• Elaeocarpus notoensis
• Elaphurus davidianus
• Elasmobranchii網
• elata, Babylonia
• Elateridae科
• Elatocladus属
• elegans, Lithophyllon
• elegans subsp. lobata, Podabacia
• elegans subsp. lobata forma vanderhorsti, Podabacia
• elegans, Minesedes
• elegans, Nododelphinula
• elegans, Paraleptolepis
• elegans, Podabacia
• elegans, Shurabia
• elegantissima, Alula
• elegantissima, Solenomorpha
• Elegant nutmeg
• elegantula, Pseudomelania
• elegantula, Turritella chichibuensis
• elegantula, Turritella (Hataiella)
• Elephant
• elephantoides, Stegodon
• Elephas属
• Elephas naumanni
• Eleutherococcus属
• Eleutherococcus sciadophylloides
• Elk
• Elliottia paniculata
• Ellipsonodosaria属
• elliptica, Cyclocardia
• elliptica, Lyonia ovalifolia
• elliptica, Siliqua
• elliptica, Venericardia
• Elm
• elongata, Acila
• elongata, Anadara amicula
• elongata, Arenomya grewingki
• elongata, Jolya
• elongata, Limopsis tokaiensis
• elongata, Mya grewingki
• elongata, Onychiopsis
• elongata, Panomya
• elongata, Thaumatopteris
• elongatus, Modiolus
• Elphidiella属
• Elphidium属
• Elphidium advenum
• Elphidium crispum
• Elphidium fax barbarense
• Elphidium fabum
• Elphidium hanzawai
• Elphidium subgranulosum
• Elphidium subincertum

• emarginata, Eurya
• emarginata, Populus
• emarginatus, Tetracyclus
• Emiluvia属
• eminulum, Cerithium
• Empetraceae科
• Empleconia属

• Enalaster nexilis
• Enallhelia属
• Enantiognathus属
• Enantiognathus ziegleri
• Encrinurus属
• Endemoconus oyamai
• Endictya robustus
• endoi, Equisetites
• endoi, Tetoria
• Endophycus wakinoensis
• Endophyllum属
• Endops yanagisawai
• Endothyra属
• Engraulidae科
• Engraulis属
• Enida japonica
• Enkianthus campanulatus
• Ennucula属
• Ennucula akitana
• Ennucula cyrenoides
• Ennucula niponica
• Ennucula nipponica
• Ennucula tenuis
• Entada mioformosana
• Enteletes属
• Enteletes acutiplicatus
• Enteletes minoensis
• Enteletes suessi
• Entemnotrochus shikamai
• Entodesma navicula
• Entodesma naviculoides
• Entolium属
• Entolium inequivalve
• Entolium ussuricus
• Entomonotis亜属
• Entomonotis ochotica
• Entomonotis ochotica var. densistriata
• Entomonotis ochotica var. eurachis

• eocenicus, Perotrochus
• Eocylichna affabilis
• Eocylichna braunsi
• Eofabiania属
• Eogoniolina johnsoni
• Eoguttulina anglica
• Eolyttonia kiryuensis
• Eomiodon属
• Eosardinella hishinaiensis
• Eoscaphander corpulenta
• eos, Margarites
• eos, Neptunea
• Eospirifer属
• Eostaffella属
• Eostegodon pseudolatidens
• Eostegodon tsudai
• Eothenomys andersoni
• Eothenomys smithii

• Epaulette tree
• Ephemeroptera目
• ephippium, Anomia
• Epigondolella属
• Epigondolella abneptis
• Epimastopora属
• Epistominella pulchella
• Epithemia属
• Epithemia adnata f. minores
• Epithemia sorex
• Epithemia sorex var. gracilis
• Epithemia turgida
• Epithemia zebra
• Epithemia zebra f. minores
• Epitoniidae科
• Epitonium属
• Epitonium angulatosimile
• Epitonium auritum
• Epitonium (Boreoscala) yokozunai
• Epitonium conjunctum
• Epitonium eusculptum
• Epitonium japonicum
• Epitonium kazusense
• Epitonium robillardi
• Epitonium sagamiense
• Epitonium yabei
• Epitonium yokozunai
• Eponides属
• Eponides karsteni
• Eptingium属
• Eptingium manfredi

• Equidae科
• Equisetites属
• Equisetites arcticum
• Equisetites bracteosus
• Equisetites endoi
• Equisetites (Equisetostachys) bracteosus
• Equisetites iwamuroensis
• Equisetites nariwensis
• Equisetites takaianus
• Equisetites ushimarensis
• Equisetostachys bracteosus
• Equisetostachys pedunculatus
• Equisetum属
• Equisetum arcticum
• Equisetum ezoense
• Equus ferus subsp. przewalskii
• Equus hemionus

• Erato属
• Ergalatax属
• Ericaceae科
• ermanii, Betula
• Erman's birch
• erminea, Mustela
• Erodona属
• Erodona amurensis
• erosa, Carpinus
• erosa, Rhodopetoma
• Erosaria属
• erythrocomata, Chlamys islandica
• erythrocomatus, Pecten
• erythrodon, Corbula
• erythrodon, Solidicorbula

• Eschrichtius属
• Eschrichtius akishimaensis
• Estherites属

• etchegoini, Chlamys swiftii
• etchegoini, Swiftopecten swiftii
• Eteoderoceras属
• etigoensis, Turritella saishuensis
• etomoensis, Cristaria muroii
• Etrema subauriformis
• ettyuensis, Dosinia

• Eubostrychoceras属
• Euclio属
• Euclio balantium
• Eucommia属
• Euconospira nipponica
• Eucrassatella nana
• Eucrassatella yabei
• Eucrate crenata
• Eucyrtidiellum属
• Eucyrtidiellum unumaense
• Eudolium nipponicum
• Euestheria属
• Euestheria kokurensis
• Eufenella pupoides
• euglypta, Cocconeis placentula
• euglypta, Leukoma
• euglypta, Protothaca
• Eumetopias属
• Eumetopias ojiyaensis
• Eumetopias sinanoensis
• Eumetopias watasei
• Eumorphotis属
• Eumorphotis multiformis
• Eunaticina属
• Eunotia属
• Euomphalus属
• Euomphalus asanoi
• Euomphalus (Straparollus)属
• Euomphalus (Straparollus) asanoi
• Euonymus属
• Eupachydiscus haradai
• Eupecten ussuricus
• Euphyllia fimbriata
• Eupodiscus sculptus
• Eupsammia imperialis
• Euptelea属
• Euptelea polyandra
• eurachis, Entomonotis ochotica
• eurachis, Monotis ochotica
• Eurasian watermilfoil
• Eurhinodelphis属
• europaeus, Glyptostrobus
• Euroscaptor属
• Eurya属
• Eurya emarginata
• Euryale属
• eurypteron, Pteropurpura falcata
• eusculptum, Epitonium
• Eusilpha japonica
• Euspira属
• Euspira ashiyaensis
• Euspira meisensis
• Euspira pallida
• Euspira pila ovata
• Eutrephoceras japonicum

• Even-toed ungulate

• exannulatus, Drepanocladus
• excavatus, Pecten
• excentricus, Coscinodiscus
• Excirolana属
• Excoecaria agallocha
• exiliformis, Cladophlebis
• exilis, Acteocina
• eximia, Monotygma
• Exotica miyatensis
• exutus, Onustus

• ezoana, Cycadeoidea
• ezoana, Keteleeria
• ezoana, Monia macrochisma
• ezoana, Planera
• ezoana, Pterocarya
• ezoana, Woodwardia
• ezoanum, Acer
• ezoanus, Placunanomia macrochisma
• Ezocallista brevisiphonata
• ezoense, Equisetum
• eozensis, Inoceramus
• eozensis, Platyceramus
• ezonis, Nuttallia